塞内加尔接受前列腺切除术的男性感染金黄杆菌：病例报告和文献综述
抽象的
我们在此报告一例罕见的尿路感染病例，该感染由金黄杆菌引起。这种广泛分布的革兰氏阴性杆菌是一种罕见的人类病原体，通常与医疗保健环境有关。
我们描述了一例由金黄杆菌引起的尿路感染病例，患者为一名 68 岁的沃洛夫族（西非塞内加尔的一个族群）男性，在前列腺切除术后 1 个月来到塞内加尔达喀尔一所大学教学医院（Hôpital Aristide Le Dantec）的泌尿外科就诊。从尿液样本中分离出的菌株经质谱法（Vitek 基质辅助激光解吸/电离、飞行时间、bioMérieux）鉴定为金黄杆菌，并经 16S 核糖体核糖核酸测序确认。该菌对多种抗生素（包括卡巴培南类）具有耐药性，因为其常驻金属-β-内酰胺酶基因与金黄杆菌 B 类酶有 99% 的氨基酸同一性。
感染 Chryseobacterium gleum 的情况并不常见，非洲此前也未报告过此类病例。尽管 Chryseobacterium gleum 的毒性较低，但应将其视为潜在的机会性新兴病原体。需要进一步研究 Chryseobacterium gleum 的流行病学、致病性和耐药机制，以便更好地诊断和治疗。
背景
金黄杆菌属（以前称为黄杆菌属）[1]，其模式种为金黄杆菌[2]，属于黄杆菌科（拟杆菌门），是一类革兰氏阴性、不发酵、过氧化氢酶阳性和吲哚阳性的需氧杆菌。金黄杆菌属是罕见的人类病原体，大多数病例是院内感染，通常与免疫抑制或留置装置有关。金黄杆菌通常存在于土壤、水、植物和食品中，可以在医院环境、氯化水和潮湿表面中存活，所有这些都是潜在的感染源。文献检索显示，只有匈牙利、印度、克罗地亚和沙特阿拉伯等国家发表了少数病例[3–6]。 20 世纪 70 年代末，塞内加尔诊断出两例由脑膜炎败血黄杆菌引起的脑膜炎病例 [7]，以及一例由产吲哚金杆菌引起的脑膜炎病例[8]。然而，此前在非洲尚未报告过人类 C. gleum 感染病例。
这里我们报告了在非洲发生的第一例C. gleum感染病例，并对世界各地的类似病例进行了回顾（表1）。
病例介绍
一名 68 岁沃洛夫族男性（西非塞内加尔的一个族群）因严重脱水和全身状况恶化来到我们泌尿外科，此前他在一家地区医院接受了经尿道前列腺切除术 1 个月。入院时，临床检查发现血压高（180/90 mmHg），发热 38.5 °C。血液检查发现白细胞增多，白细胞 (WBC) 水平为 17,100/mL，贫血水平为 10 g/dL，肌酐水平为 513.3 μmol/L。血清电解质显示低钠血症为 111 mEq/L，低钾血症为 3.3 mEq/L，低氯血症为 77 mEq/L。就诊时，他体内留置导尿管，尿液引流不正常，需要进行尿液细菌学检查。
治疗包括补充液体和电解质、每日包扎伤口以及使用阿米卡星进行经验性抗生素治疗。选择该药物是因为感染严重，并且我们的患者之前曾接受过氟喹诺酮类药物治疗。住院七天后，结果良好，手术伤口干净，血清钾和氯化物水平恢复正常。然而，低钠血症持续存在，为 119 mEq/L，血清肌酐水平为 150.45 μmol/L。住院第 7 天拔除导尿管，当天患者回家。
将住院期间采集的用于细菌学检查的浑浊尿按医学细菌学常规技术接种于半胱氨酸乳糖电解质缺乏（CLED）琼脂平板上，直接检查可见菌群丰富，白细胞较多，革兰氏染色可见革兰氏阴性杆菌，CLED琼脂上长有黄色1～2 mm圆形菌落（>106CFU/mL），边缘规则。
培养后，由于产生柔红素而出现黄色菌落，怀疑为 Chryseobacterium 菌种。使用 Appareil et Procédés d’Identification 20 NE 鉴定系统（法国 bioMérieux）进行鉴定，培养 24 小时和 48 小时后，分别得到 Myroides 菌种和 C. indologenes（表 2）。
然而，质谱法（Vitek MS 基质辅助激光解吸/电离、飞行时间、bioMérieux）成功鉴定出 C. gleum，并使用 16S 核糖体核糖核酸 (rRNA) 测序证实了该结果。
在本例中，根据培养报告，C. gleum 被确认为我们患者尿路感染的病原体。尿液中纯菌的汇合生长有助于排除污染。
使用纸片扩散法和 E-tests（bioMérieux）对铜绿假单胞菌 ATCC 27853 和大肠杆菌 ATCC 25922 进行最低抑菌浓度 (MIC) 抗菌敏感性测试，用于内部质量控制，并按照法国微生物学会抗生素耐药性委员会 (CA-SFM) 2015 年的建议进行解释。分离的菌株对哌拉西林 (MIC = 6 μg/mL)、头孢他啶 (MIC = 0.75 μg/mL)、头孢吡肟 (MIC = 0.125 μg/mL)、环丙沙星 (MIC = 0.25 μg/mL)、亚胺培南 (MIC = 2 μg/mL) 敏感，对美罗培南 (MIC = 8 μg/mL)、氨曲南(MIC ≥256 μg/mL)、替卡西林 (MIC ≥256 μg/mL)、替卡西林-克拉维酸 (MIC = 64 μg/mL) 和头孢噻肟 (MIC >32 μg/mL；表 3)。
由于对卡巴培南的敏感性降低，亚胺培南和乙二胺四乙酸 (EDTA) 的联合试验呈阳性，表明产生了金属-β-内酰胺酶 (MBL)。为了鉴定编码 MBL 的基因，使用苯酚-氯仿提取获得的基因组脱氧核糖核酸 (DNA) 进行聚合酶链式反应 (PCR)，使用模板引物 CGB1_exp/fw (5′-GGGAATTCCATATGAAAAAAAGCATTCCGTTTTTTA) 和 CGB1_exp/rv (CGCGGATCCTTATTTTTTATTTAAAAGATCAAG)，如 Bellais 及其同事先前所述 [9]。对编码 242 个氨基酸前蛋白的 726 个碱基对 (bp) 扩增片段的 DNA 序列分析显示与 CGB-1 有 99% 的相似性（图 1）。
图 1
β-内酰胺酶 CGB-1 的氨基酸序列与我们的菌株的比较。虚线表示相同的氨基酸残基。垂直箭头表示 CGB-1 前导肽的假定裂解位点。可能参与锌 (Zn2+) 或/和水结合的氨基酸用星号表示。阴影对应于我们菌株基因中发生的单个氨基酸突变
讨论
C. gleum 是一种不常见的人类病原体，据报道是 3 例新生儿早期呼吸道感染的病因 [3]。引起人类疾病的最常见种类是 F. meningosepticum，其次是 C. indologenes 和 C. gleum[10]。C. gleum 通常被认为是一种低毒力生物，但它可能导致严重感染，尤其是在免疫功能低下的患者中。正如之前报道的那样，这种生物体在患者体内的定植可以通过涉及液体的受污染医疗设备发生，例如插管、呼吸器、加湿器和新生儿恒温箱 [11]。文献中几乎所有出版物都提到长期住院和长期抗生素治疗（> 14 天）、肿瘤疾病，并且大多数患者都有免疫抑制或留置装置 [8–11]。2016 年发表的沙特阿拉伯最新病例报道了 C.一名 6 个月大的肾病综合征婴儿感染了 C. gleum 肺炎 [6]。插管后，患者之前接受过多种抗生素治疗，包括美罗培南、头孢曲松和万古霉素。Viroke 等人于 2014 年报道了一例匈牙利新生儿早期呼吸道感染病例，该病例由 C. gleum 引起 [3]。在克罗地亚，Dijana 等人于 2015 年发表了一例营养不良和肝病变患者感染 C. gleum 的病例 [5]。呼吸功能不全的患者出现了感染性休克，需要插管和机械通气。我们的患者在一家地区医院接受了前列腺切除术，留置了导尿管；他发生了由 C. gleum 引起的泌尿道感染，类似于 Ramya 等人在 2015 年报道的印度病例 [4]。
目前，人们对 Chryseobacterium 成员的毒力因子知之甚少，尽管有报道表明生物膜和蛋白酶的产生是 Elizabethkingia meningoseptica (以前称为 Chryseobacterium meningosepticum) 和 C. indologenes 毒力的重要机制[11]。最近注意到 C. indologenes 在中心静脉导管相关血流感染中会形成生物膜 [12]。E. meningoseptica 分离株在 Luria-Bertani (LB) 培养基中表现出 100% 的生物膜形成能力，并且生物膜生成的增加与感染患者的死亡率相关 [13]。Lo 和 Chang 对 14C. gleum 分离株进行了重点研究 [14]，这些菌株在流行病学上无关，主要来源于尿液和痰液。他们的研究表明，40% 的 C. gleum 分离株可以形成生物膜。C. gleum 的毒性似乎远低于脑膜炎败血性肠炎杆菌。因此，有人认为 gleum 的毒性可能低于脑膜炎败血性肠炎杆菌和吲哚芽孢杆菌。事实上，我们之前曾报道过一例因吲哚芽孢杆菌而导致尿路感染的急性白血病女性死亡病例 [8]。这一结果与本病例形成鲜明对比，本病例中患者尽管营养不良，但仍幸存下来。
在 1997 年至 2001 年的 5 年期间，SENTRY 抗菌监测项目收集的所有加工非发酵革

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