一名斯里兰卡女孩因 PKLR 基因出现新的遗传变异而导致丙酮酸激酶缺乏症:病例报告
抽象的
红细胞丙酮酸激酶在位于 1q21 染色体上的 PKLR 基因的控制下表达。丙酮酸激酶催化糖酵解途径的最后步骤,并产生 50% 的红细胞总三磷酸腺苷。丙酮酸激酶缺乏症是最常见的糖酵解缺陷,导致先天性非球形红细胞溶血性贫血,该病为常染色体隐性遗传,其中纯合子和复合杂合子很常见。丙酮酸激酶缺乏症患者中已描述了 200 多种突变。本病例报告确定了在患有严重丙酮酸激酶缺乏症的患者中检测到的 PKLR 基因中的一种新致病变异。
一名斯里兰卡僧伽罗族女孩在出生后 24 小时内出现新生儿贫血和黄疸,并伴有轻度肝肿大。该女孩为非近亲结婚,有两个兄弟姐妹,均未患血液病。她因类似疾病多次入院,8 岁时被发现患有丙酮酸激酶缺乏症,与 PKLR 基因中新的纯合致病变异 c.507+1delG 有关。
在一名斯里兰卡女孩身上检测到了 PKLR 基因的新型遗传变异,与丙酮酸激酶缺乏症相符。这种遗传变异可能是亚洲人群所特有的,需要进一步研究。
背景
成熟的红细胞缺乏线粒体,因此依赖糖酵解来生成三磷酸腺苷 (ATP)。丙酮酸激酶 (PK) 催化糖酵解途径的最后步骤,产生 50% 的总红细胞 ATP [1]。人类 PK 受四种酶的表达调节。红细胞 PK 仅限于 R 型同工酶,由位于染色体 1q21 上的 PKLR 基因(转录本 NM_000298.5,3053 bp)的表达产生。
丙酮酸激酶缺乏症 (PKD) 是最常见的糖酵解缺陷,可导致先天性非球形红细胞溶血性贫血,属于常染色体隐性遗传,其中纯合子和复合杂合子很常见 [1]。据估计,白种人中该病的患病率为每百万人口 51 人 [1]。目前尚无斯里兰卡 PKD 患病率的数据。PKD 中已描述了 200 多种突变 [1]。最常见的是错义突变,包括美国、北欧和中欧的 c.1529G>A、(p.Arg510Gln);南欧的 c.1456C>T、(p.Arg486Trp);以及亚洲的 c.1468C>T、(p.Arg490Trp) [1,2]。小的缺失、插入和移码突变很少见,已报道了一些大的缺失 [2]。本报告重点介绍了 PKLR 基因中一种新的致病变异,此前未描述过,该变异发生在一名非球形红细胞溶血性贫血患者身上。有趣的是,尽管该患者是无血缘关系的父母所生,但她的基因变异是纯合的。
病例介绍
一名 8 岁的斯里兰卡僧伽罗女孩,是非近亲结婚的父母的第三个孩子,于妊娠 37 周时通过选择性剖宫产出生,阿普伽评分为 18、59 和 109。她的产前史顺利,出生体重 2.13 公斤,头围 35 厘米。没有贫血或其他血液病家族史。出生后 2 小时(T= 0),她面色苍白,皮肤和巩膜变黄,高度提示溶血。她的血压为 80/55 mmHg,脉搏率 > 100 次/分钟,并且水分充足。她没有发烧或体温过低。她没有任何畸形、淋巴结肿大或脾肿大。肝肿大无痛。系统检查正常,包括无局灶性神经系统表现和肢体无力。初次就诊时,她的血红蛋白 (Hb) 为 55 g/L,白细胞正常(总白细胞计数 8.8 × 109/L、中性粒细胞 60%、有核红细胞和淋巴细胞 35%)和血小板 (430 × 109/L)。血涂片显示红细胞不均一性,伴有明显的多染性。网织红细胞计数为 9.6%。总胆红素为 15.6 mg/dL,间接胆红素为 13 mg/dL。其余肝功能和肾功能检查均在正常范围内。没有血管内溶血的实验室证据。尿液分析显示尿胆原增加。细菌和病毒感染筛查结果为阴性。母子均为 Rh 阳性,两人的直接 Coombs 试验均为阴性。此外,母亲的抗体筛查结果为阴性。由于怀疑婴儿可能存在罕见的血型不相容,因此对其进行了双倍容量换血和光疗,尽管直接库姆斯血检结果为阴性。
一个月后(T= 1),她出现贫血症状,血红蛋白降至 45 g/L。对她进行了 G6PD 缺乏症筛查,发现 G6PD 酶水平正常,为 6.60 µg/dL(正常范围 4.60–13.5 µg/dL),Brewer 试验正常。渗透脆性试验也为阴性。高效液相色谱 (HPLC) 检测血红蛋白,未显示在 4 个月大时有 β-地中海贫血或血红蛋白变异的证据。这与对斯里兰卡导致 β-地中海贫血的五种常见 β-珠蛋白基因突变(IVSI-1G>A、IVSI-5G>C、Cd8/9、Cd41/42)和 HbE(HBB:c.79G>A、p.Glu27Lys)的基因分析一致,这些突变在她的 DNA 样本中均未检测到。骨髓活检结果符合溶血性贫血和铁储量增加的症状。未评估丙酮酸激酶活性和 2,3-双磷酸甘油酸水平,因为斯里兰卡没有进行这些检查。由于相似的临床特征,她多次入院。8 岁时,对提供给伦敦国王学院医院合作者的血液样本进行了 PKLR 基因的桑格测序,他们建立了丙酮酸激酶基因 (PKLR) 的诊断性基因测序检测。由于斯里兰卡是一个中低收入国家,并且斯里兰卡没有这种测试,因此该儿童的基因测试无需患者支付任何费用。基因测序表明,她为 c.507+1delG 致病变异纯合子,该变异删除了外显子 4 后的内含子的第一个碱基。外显子 4 的最后一个密码子是 GGG(甘氨酸),内含子中紧随其后的是 GT,内含子中的 G 碱基被删除。因此,该变异影响了典型的 5ʹ 供体剪接位点。由于前面的外显子碱基也是 GGG,因此预测供体剪接位点位于外显子内一个碱基处,转录本将删除最后一个 G 碱基,导致蛋白质序列发生移码,预测为 p.(Gly170Valfs*9)。这些异常转录本通常通过无义介导的衰变去除。由于该个体为纯合子,她不产生任何丙酮酸激酶,这与丙酮酸激酶缺乏症的诊断一致。
她没有接受任何针对溶血的特殊干预措施。自 8 岁确诊以来,她持续出现低度溶血,每 1-2 个月定期输血一次。这导致铁过载,因此她正在服用地拉罗司。她每月都在血液科诊所